dear colleague,
Two events organized by the ebioscience group of the Bioinformatics Laboratory will take place at the Academic Medical Center of the University of Amsterdam on 21-25 May.
The themes focus on the usage of advanced research infrastructures for medical research and life sciences. Below you find more information
Could you please distribute this to anyone who might be interested?
Note: early bird registration closes on April 10, please register soon!
many thanks,
Silvia Olabarriaga
Academic Medical Center, University of Amsterdam
S.D.Olabarriaga(a)amc.uva.nl
===========
The Tenth HealthGrid Conference and the Fourth International Workshop on Science Gateways for Life Sciences (IWSG-Life) will take place at the Academic Medical Center of the University of Amsterdam in 21-25 May 2012. These events offer a forum to discuss the integration of grid, cloud and other e-infrastructures into the fields of biology, bioinformatics, biomedicine and healthcare. The program will featurescientific and lightening presentations, demonstration of projects and software, and tutorials. A wide range of topics will be covered by the various activities, from technologies to biomedical research, and from portals to workflow and computational modeling. This year the events will also include a discussion on scientific gateways chaired by EGI.eu, and a retrospective of ten years of HealthGrid conferences. The confirmed keynote speakers are Tony Solomonides (NorthShore University HealthSystem, US), Shantenu Jha (Rutgers University, US), Roberto Barbera (University of Catania and INFN, IT), Nancy Wilkins-Diehr (University of California, San Diego, US) and Peter Kacsuk (MTA SZTAKI, Budapest, Hu).
Registration is now open; please check the websites for more information:
http://amsterdam2012.healthgrid.orghttp://iwsg-life.org/2012
De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u verzocht de inhoud niet te gebruiken en de afzender direct te informeren door het bericht te retourneren. Het Academisch Medisch Centrum is een publiekrechtelijke rechtspersoon in de zin van de W.H.W. (Wet Hoger Onderwijs en Wetenschappelijk Onderzoek) en staat geregistreerd bij de Kamer van Koophandel voor Amsterdam onder nr. 34362777. De Algemene Inkoop Voorwaarden van het AMC zijn van toepassing op en maken integraal onderdeel uit van alle rechtsbetrekkingen, daaronder mede verstaan alle inkoop opdrachten en overeenkomsten, tussen AMC en derden. Deze voorwaarden zijn te raadplegen op www.amc.nl en worden op verzoek toegezonden.
________________________________
This message may contain confidential information and is intended exclusively for the addressee. If you receive this message unintentionally, please do not use the contents but notify the sender immediately by return e-mail. Academic Medical Center is a legal person by public law and is registered at the Chamber of Commerce for Amsterdam under no. 34362777. The AMC General Purchase Terms constitute an integral part of all legal relations, including but not limited to all purchase orders and contracts, between the AMC and third parties. These terms can be downloaded at the website www.amc.nl and will be sent to you at your request.
When: Thursday April 12th, 17.15 - 20.30
Where: Science Park, Amsterdam, Netherlands
Theme: Data science: how to generate value from your data
Speakers: Joaquin Vanschoren on dealing with sensor data with Hadoop
Edgar Meij on Information Retrieval
RSVP & more: http://www.meetup.com/Netherlands-Hadoop-User-Group/
We'll have pizza and beer waiting!
Hope to see you then,
___________________________________________
Evert Lammerts
SARA
Phone: +31 6 10558303, +31 20 5923017
Hoi Erik,
De downtijd is ingeplanned van 8-17 uur UTC dus kies maar uit.
Gr.,
Ron
> -----Original Message-----
> From: Erik Ruiter
> Sent: dinsdag 13 maart 2012 12:59
> To: Ron Trompert
> Cc: Onno Zweers; grid-adm(a)sara.nl; ct-grid; SARA NOC
> Subject: Re: [SARA-NIS#143] Re: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
>
> Hoi Ron,
>
> Jazeker. Ik weet alleen nog niet het meest geschikte tijdstip. Is er
> een voorkeur?
>
> Groet, Erik.
>
> Verstuurd vanaf mijn iPhone
>
> Op 13 mrt. 2012 om 09:59 heeft "Ron Trompert" <ron(a)sara.nl> het
> volgende geschreven:
>
> > Hoi Erik,
> >
> > Gaat het nog door de 20e?
> >
> > Gr.,
> >
> > Ron
> >
> >> -----Original Message-----
> >> From: Erik Ruiter [mailto:Erik.Ruiter@sara.nl]
> >> Sent: vrijdag 9 maart 2012 16:11
> >> To: Onno Zweers
> >> Cc: grid-adm(a)sara.nl; ct-grid; SARA NOC
> >> Subject: Re: [SARA-NIS#143] Re: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
> >>
> >> Hoi Onno,
> >>
> >> Wat mij betreft prima.
> >> Ik wacht nog op feedback van Nikhef (heb tristan eereder deze week
> >> gemaild).
> >> Als NIKHEF akkoord is bespreken we nog wel een precies tijdstip.
> >>
> >> Groet,
> >>
> >> Erik.
> >>
> >>
> >> On 9/3/12 14:53 , "Onno Zweers" <onno.zweers(a)sara.nl> wrote:
> >>
> >>> Hoi Erik,
> >>>
> >>> CC Nikhef.
> >>>
> >>> Ik stel voor: dinsdag 20 maart. De is ruim een week van tevoren dus
> >> mooi
> >>> scheduled. En de mass storage heeft dan al een downtime dus is dat
> >> mooi
> >>> te combineren.
> >>>
> >>> Groetjes
> >>> Onno
> >>>
> >>> Op 09-03-12 14:24, Erik Ruiter schreef:
> >>>> Beste grid beheerders,
> >>>>
> >>>> Graag jullie aandacht en feedback aangaande onderstaande.
> >>>>
> >>>> Alvast bedankt.
> >>>>
> >>>> Groet,
> >>>>
> >>>> Erik Ruiter
> >>>>
> >>>> t: +31 (0) 20 888 4136
> >>>> e: erik.ruiter(a)sara.nl
> >>>> I: www.sara.nl
> >>>>
> >>>> SARA Reken- en Netwerkdiensten
> >>>> Sciencepark 140
> >>>> 1098 XH Amsterdam
> >>>>
> >>>>
> >>>>
> >>>>
> >>>>
> >>>> On 7/3/12 8:50 , "Erik Ruiter"<erik.ruiter(a)sara.nl> wrote:
> >>>>
> >>>>> Hoi Ron,
> >>>>>
> >>>>> Inmiddels is de grid-r1 uitbreiding gedaan, en is er een extra
> >> fiber
> >>>>> naar
> >>>>> NIKHEF opgeleverd.
> >>>>> We zijn dus gereed om de NIKHEF verbinding te verdubbelen naar 20
> >> Gbps.
> >>>>>
> >>>>> Dit zal in 3 stappen moeten gebeuren in coördinatie met NIKHEF.
> >>>>>
> >>>>> 1. Verbinding tussen grid-r3 en Grid-r1 upgraden naar 20 Gbps dmv
> >> een
> >>>>> portchannel (max 2 min. Outage)
> >>>>> 2. Huidige NIKHEF verbinding verplaatsen van SARA-R1 naar Grid-R1
> >> (Max
> >>>>> 5
> >>>>> min. outage)
> >>>>> 3. Portchannel en routing opbrengen richting NIKHEF (Max 5 min.
> >>>>> outage.)
> >>>>>
> >>>>> Dit betekent dus een korte outage naar NIKHEF, maar ook een korte
> >>>>> outage
> >>>>> tussen grid-r1 en grid-r3.
> >>>>>
> >>>>> Wanneer zou jullie dit het beste uitkomen?
> >>>>>
> >>>>> Groet,
> >>>>>
> >>>>> Erik.
> >>>>>
> >>>>>
> >>>>>
> >>>>> On 21/12/11 8:45 , "Sander Boele"<sanderb(a)sara.nl> wrote:
> >>>>>
> >>>>>> Hoi Axel, Ron,
> >>>>>>
> >>>>>> On 21-12-11 7:59 , "Axel Berg"<Axel(a)sara.nl> wrote:
> >>>>>>
> >>>>>>> Hoi Sander,
> >>>>>>>
> >>>>>>> Kun je aangeven welke eventuele extra kosten hiermee zijn
> >> gemoeid, if
> >>>>>>> any?
> >>>>>>
> >>>>>> Sowieso de colo kosten, fiber moet verhuisd worden van sara-r1
> >> naar
> >>>>>> grid-r1 en er is een nieuwe fiber nodig naar NIKHEF.
> >>>>>>
> >>>>>> De optics hebben we allemaal wel, ik ben niet 100% zeker over de
> >>>>>> optic in
> >>>>>> grid-r3, maar als we die nieuw moeten kopen kost dat +/- 350
> euro.
> >>>>>>
> >>>>>>>
> >>>>>>> gr Axel
> >>>>>>>
> >>>>>>> -----Original Message-----
> >>>>>>> From: Ron Trompert
> >>>>>>> Sent: woensdag 21 december 2011 7:58
> >>>>>>> To: Sander Boele
> >>>>>>> Cc: SARA NOC; Maurice Bouwhuis; Axel Berg
> >>>>>>> Subject: RE: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
> >>>>>>>
> >>>>>>>
> >>>>>>> Hoi Sander,
> >>>>>>>
> >>>>>>> Op welke termijn kunnen we dit realiseren?
> >>>>>>
> >>>>>>
> >>>>>> Ik kreeg net gisteren te horen dat de uitbreiding van grid-r1
> bij
> >> de
> >>>>>> Nederlands douane ligt. Als alles mee zit komt het vrijdag
> binnen.
> >> Ik
> >>>>>> ga
> >>>>>> alleen niet de laatste dag voor de kerstsluiting grid-r1 uit
> >> elkaar
> >>>>>> halen,
> >>>>>> want hij moet ook een power/fan/cooling upgrade hebben voordat
> we
> >> het
> >>>>>> nieuwe bord kunnen huisvesten.
> >>>>>>
> >>>>>> Begin volgend jaar.
> >>>>>>
> >>>>>> Groet,
> >>>>>>
> >>>>>> Sander
> >>>>>>
> >>>>>
> >>>>
> >>>> _______________________________________________
> >>>> Grid-adm mailing list
> >>>> Grid-adm(a)lists.osd.sara.nl
> >>>> https://lists.osd.sara.nl/listinfo/grid-adm
> >>>
> >>>
> >>> --
> >>> Onno Zweers, system programmer
> >>> e-Science & cloud services
> >>> SARA
> >>> Science Park 121
> >>> 1098 XG Amsterdam
> >>> The Netherlands
> >>>
> >>> Phone +31-(0)20-5928063
> >>> Mobile +31-(0)6-19039004
> >>> onno.zweers(a)sara.nl
> >>> MSN: onnozweers(a)hotmail.com
> >>> Jabber: onnozweers(a)jabber.org
> >>> http://twitter.com/onnix
> >>>
> >>
> >> _______________________________________________
> >> Grid-adm mailing list
> >> Grid-adm(a)lists.osd.sara.nl
> >> https://lists.osd.sara.nl/listinfo/grid-adm
Hoi Erik,
Gaat het nog door de 20e?
Gr.,
Ron
> -----Original Message-----
> From: Erik Ruiter [mailto:Erik.Ruiter@sara.nl]
> Sent: vrijdag 9 maart 2012 16:11
> To: Onno Zweers
> Cc: grid-adm(a)sara.nl; ct-grid; SARA NOC
> Subject: Re: [SARA-NIS#143] Re: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
>
> Hoi Onno,
>
> Wat mij betreft prima.
> Ik wacht nog op feedback van Nikhef (heb tristan eereder deze week
> gemaild).
> Als NIKHEF akkoord is bespreken we nog wel een precies tijdstip.
>
> Groet,
>
> Erik.
>
>
> On 9/3/12 14:53 , "Onno Zweers" <onno.zweers(a)sara.nl> wrote:
>
> >Hoi Erik,
> >
> >CC Nikhef.
> >
> >Ik stel voor: dinsdag 20 maart. De is ruim een week van tevoren dus
> mooi
> >scheduled. En de mass storage heeft dan al een downtime dus is dat
> mooi
> >te combineren.
> >
> >Groetjes
> >Onno
> >
> >Op 09-03-12 14:24, Erik Ruiter schreef:
> >> Beste grid beheerders,
> >>
> >> Graag jullie aandacht en feedback aangaande onderstaande.
> >>
> >> Alvast bedankt.
> >>
> >> Groet,
> >>
> >> Erik Ruiter
> >>
> >> t: +31 (0) 20 888 4136
> >> e: erik.ruiter(a)sara.nl
> >> I: www.sara.nl
> >>
> >> SARA Reken- en Netwerkdiensten
> >> Sciencepark 140
> >> 1098 XH Amsterdam
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >> On 7/3/12 8:50 , "Erik Ruiter"<erik.ruiter(a)sara.nl> wrote:
> >>
> >>> Hoi Ron,
> >>>
> >>> Inmiddels is de grid-r1 uitbreiding gedaan, en is er een extra
> fiber
> >>>naar
> >>> NIKHEF opgeleverd.
> >>> We zijn dus gereed om de NIKHEF verbinding te verdubbelen naar 20
> Gbps.
> >>>
> >>> Dit zal in 3 stappen moeten gebeuren in coördinatie met NIKHEF.
> >>>
> >>> 1. Verbinding tussen grid-r3 en Grid-r1 upgraden naar 20 Gbps dmv
> een
> >>> portchannel (max 2 min. Outage)
> >>> 2. Huidige NIKHEF verbinding verplaatsen van SARA-R1 naar Grid-R1
> (Max
> >>>5
> >>> min. outage)
> >>> 3. Portchannel en routing opbrengen richting NIKHEF (Max 5 min.
> >>>outage.)
> >>>
> >>> Dit betekent dus een korte outage naar NIKHEF, maar ook een korte
> >>>outage
> >>> tussen grid-r1 en grid-r3.
> >>>
> >>> Wanneer zou jullie dit het beste uitkomen?
> >>>
> >>> Groet,
> >>>
> >>> Erik.
> >>>
> >>>
> >>>
> >>> On 21/12/11 8:45 , "Sander Boele"<sanderb(a)sara.nl> wrote:
> >>>
> >>>> Hoi Axel, Ron,
> >>>>
> >>>> On 21-12-11 7:59 , "Axel Berg"<Axel(a)sara.nl> wrote:
> >>>>
> >>>>> Hoi Sander,
> >>>>>
> >>>>> Kun je aangeven welke eventuele extra kosten hiermee zijn
> gemoeid, if
> >>>>> any?
> >>>>
> >>>> Sowieso de colo kosten, fiber moet verhuisd worden van sara-r1
> naar
> >>>> grid-r1 en er is een nieuwe fiber nodig naar NIKHEF.
> >>>>
> >>>> De optics hebben we allemaal wel, ik ben niet 100% zeker over de
> >>>>optic in
> >>>> grid-r3, maar als we die nieuw moeten kopen kost dat +/- 350 euro.
> >>>>
> >>>>>
> >>>>> gr Axel
> >>>>>
> >>>>> -----Original Message-----
> >>>>> From: Ron Trompert
> >>>>> Sent: woensdag 21 december 2011 7:58
> >>>>> To: Sander Boele
> >>>>> Cc: SARA NOC; Maurice Bouwhuis; Axel Berg
> >>>>> Subject: RE: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
> >>>>>
> >>>>>
> >>>>> Hoi Sander,
> >>>>>
> >>>>> Op welke termijn kunnen we dit realiseren?
> >>>>
> >>>>
> >>>> Ik kreeg net gisteren te horen dat de uitbreiding van grid-r1 bij
> de
> >>>> Nederlands douane ligt. Als alles mee zit komt het vrijdag binnen.
> Ik
> >>>>ga
> >>>> alleen niet de laatste dag voor de kerstsluiting grid-r1 uit
> elkaar
> >>>> halen,
> >>>> want hij moet ook een power/fan/cooling upgrade hebben voordat we
> het
> >>>> nieuwe bord kunnen huisvesten.
> >>>>
> >>>> Begin volgend jaar.
> >>>>
> >>>> Groet,
> >>>>
> >>>> Sander
> >>>>
> >>>
> >>
> >> _______________________________________________
> >> Grid-adm mailing list
> >> Grid-adm(a)lists.osd.sara.nl
> >> https://lists.osd.sara.nl/listinfo/grid-adm
> >
> >
> >--
> >Onno Zweers, system programmer
> >e-Science & cloud services
> >SARA
> >Science Park 121
> >1098 XG Amsterdam
> >The Netherlands
> >
> >Phone +31-(0)20-5928063
> >Mobile +31-(0)6-19039004
> >onno.zweers(a)sara.nl
> >MSN: onnozweers(a)hotmail.com
> >Jabber: onnozweers(a)jabber.org
> >http://twitter.com/onnix
> >
>
> _______________________________________________
> Grid-adm mailing list
> Grid-adm(a)lists.osd.sara.nl
> https://lists.osd.sara.nl/listinfo/grid-adm
Hoi Erik,
CC Nikhef.
Ik stel voor: dinsdag 20 maart. De is ruim een week van tevoren dus mooi
scheduled. En de mass storage heeft dan al een downtime dus is dat mooi
te combineren.
Groetjes
Onno
Op 09-03-12 14:24, Erik Ruiter schreef:
> Beste grid beheerders,
>
> Graag jullie aandacht en feedback aangaande onderstaande.
>
> Alvast bedankt.
>
> Groet,
>
> Erik Ruiter
>
> t: +31 (0) 20 888 4136
> e: erik.ruiter(a)sara.nl
> I: www.sara.nl
>
> SARA Reken- en Netwerkdiensten
> Sciencepark 140
> 1098 XH Amsterdam
>
>
>
>
>
> On 7/3/12 8:50 , "Erik Ruiter"<erik.ruiter(a)sara.nl> wrote:
>
>> Hoi Ron,
>>
>> Inmiddels is de grid-r1 uitbreiding gedaan, en is er een extra fiber naar
>> NIKHEF opgeleverd.
>> We zijn dus gereed om de NIKHEF verbinding te verdubbelen naar 20 Gbps.
>>
>> Dit zal in 3 stappen moeten gebeuren in coördinatie met NIKHEF.
>>
>> 1. Verbinding tussen grid-r3 en Grid-r1 upgraden naar 20 Gbps dmv een
>> portchannel (max 2 min. Outage)
>> 2. Huidige NIKHEF verbinding verplaatsen van SARA-R1 naar Grid-R1 (Max 5
>> min. outage)
>> 3. Portchannel en routing opbrengen richting NIKHEF (Max 5 min. outage.)
>>
>> Dit betekent dus een korte outage naar NIKHEF, maar ook een korte outage
>> tussen grid-r1 en grid-r3.
>>
>> Wanneer zou jullie dit het beste uitkomen?
>>
>> Groet,
>>
>> Erik.
>>
>>
>>
>> On 21/12/11 8:45 , "Sander Boele"<sanderb(a)sara.nl> wrote:
>>
>>> Hoi Axel, Ron,
>>>
>>> On 21-12-11 7:59 , "Axel Berg"<Axel(a)sara.nl> wrote:
>>>
>>>> Hoi Sander,
>>>>
>>>> Kun je aangeven welke eventuele extra kosten hiermee zijn gemoeid, if
>>>> any?
>>>
>>> Sowieso de colo kosten, fiber moet verhuisd worden van sara-r1 naar
>>> grid-r1 en er is een nieuwe fiber nodig naar NIKHEF.
>>>
>>> De optics hebben we allemaal wel, ik ben niet 100% zeker over de optic in
>>> grid-r3, maar als we die nieuw moeten kopen kost dat +/- 350 euro.
>>>
>>>>
>>>> gr Axel
>>>>
>>>> -----Original Message-----
>>>> From: Ron Trompert
>>>> Sent: woensdag 21 december 2011 7:58
>>>> To: Sander Boele
>>>> Cc: SARA NOC; Maurice Bouwhuis; Axel Berg
>>>> Subject: RE: uitbreiding connectiviteit NIKHEF
>>>>
>>>>
>>>> Hoi Sander,
>>>>
>>>> Op welke termijn kunnen we dit realiseren?
>>>
>>>
>>> Ik kreeg net gisteren te horen dat de uitbreiding van grid-r1 bij de
>>> Nederlands douane ligt. Als alles mee zit komt het vrijdag binnen. Ik ga
>>> alleen niet de laatste dag voor de kerstsluiting grid-r1 uit elkaar
>>> halen,
>>> want hij moet ook een power/fan/cooling upgrade hebben voordat we het
>>> nieuwe bord kunnen huisvesten.
>>>
>>> Begin volgend jaar.
>>>
>>> Groet,
>>>
>>> Sander
>>>
>>
>
> _______________________________________________
> Grid-adm mailing list
> Grid-adm(a)lists.osd.sara.nl
> https://lists.osd.sara.nl/listinfo/grid-adm
--
Onno Zweers, system programmer
e-Science & cloud services
SARA
Science Park 121
1098 XG Amsterdam
The Netherlands
Phone +31-(0)20-5928063
Mobile +31-(0)6-19039004
onno.zweers(a)sara.nl
MSN: onnozweers(a)hotmail.com
Jabber: onnozweers(a)jabber.org
http://twitter.com/onnix