|
|
| Nummer februari 2016 |
 |
|
|
|
Cursussen
en evenementen |
|
|
| 9
maart 2016 - Open e-IRG Workshop
in Amsterdam ⇒
|
|
De registratie is nu open
voor de volgende Open e-IRG
Workshop over de "Voortgang
van de e-Infrastructuur
Commons: integratie en
interoperabiliteit -
financiering en modellen
voor inkomsten". De workshop
vindt plaats op 9 maart aan
het Amsterdam Science Park.
In deze workshop wil e-IRG
de vooruitgang evalueren van
de e-Infrastructuur Commons:
Wat is er tot dusver
bereikt? Wat werd er niet
gerealiseerd, en waarom
niet? Wat zijn de
technische, financiele,
politieke, en culturele
blokkades? Hoe kunnen we van
elkaar leren? De sprekers
zullen hun inzichten delen
over de ontwikkelingen aan
de vraagzijde, de rol van de
markt in samenspel met de
nationale e-infrastructuur
aanbieders, en de
mechanismes voor subsidie.
Als sprekers werden
uitgenodigd de voormalige
vice president van Microsoft
Research Connections Tony
Hey, NCSA directeur Ed
Seidel, ESFRI
ondervoorzitter Giorgio
Rossi en Barend Mos,
voorzitter van de High Level
Expert Groep van de Europese
Commissie voor de Europese
Open Science Cloud. Zij
zullen het hebben over het
internationale
e-infrastructuur landschap,
de trends en de richting
voor de toekomst.
|
|
|
|
| 10
maart 2016 - Presentatie van de
ESFRI Roadmap 2016 in Amsterdam →
|
|
Op 10 maart a.s. presenteert
het European Strategy Forum
on Research Infrastructures
(ESFRI) de ESFRI Roadmap
2016 voor grootschalige
onderzoeksfaciliteiten
tijdens een eendaagse
conferentie in het
Trippenhuis van de KNAW in
Amsterdam. De conferentie
wordt live gestreamd op
internet. Het ESFRI brengt
onderzoeksfaciliteiten van
pan-Europees belang in kaart
op alle wetenschappelijke
vakgebieden die aansluiten
bij de langetermijnbehoeften
van de Europese
onderzoeksgemeenschap De
publicatie van regelmatig
herziene ESFRI Roadmaps - de
eerste roadmap werd
gepubliceerd in 2006 - biedt
de Raad van de Europese Unie
een coherente en
strategische visie. Dit is
belangrijk om ervoor te
zorgen dat Europa beschikt
over hoogwaardige
onderzoeksfaciliteiten die
toegankelijk zijn voor alle
toponderzoekers, zodat de
wetenschappelijke wereld
zijn potentieel optimaal kan
benutten.
|
|
|
|
| 4-5
april 2016 - Open Science
Conferentie in Amsterdam ⇒
|
|
Tijdens deze conferentie die
plaatsvindt onder het
Europese Voorzitterschap van
Nederland bij het Marine
Etablissement Amsterdam
kunnen lidstaten en
belanghebbenden van
gedachten wisselen met
betrekking tot de overgang
naar Open Science. Tevens
wordt het Open Science
Beleidsplatform gelanceerd
en wordt er een gezamenlijke
agenda voor acties
opgesteld. Het
deelnemersveld bestaat uit
politici en beleidsmakers,
en Europese belanghebbenden,
zoals onderzoekers,
uitgevers,
vertegenwoordigers van
universiteiten en
onderzoeksinstellingen,
alsmede organisaties en
bedrijven die onderzoek
ondersteunen. Op 4 april
verwelkomt Staatssecretaris
voor Onderwijs, Cultuur en
Wetenschap Sander Dekker de
deelnemers. Europees
Commissaris Carlos Moedas en
andere sprekers zullen hun
visie schetsen over het
belang van Open Science voor
Europa en de kansen die dit
biedt. Belanghebbenden en
gebruikers van
wetenschappelijk onderzoek,
alsmede onderzoekers zullen
van ideeen wisselen. Op 5
april ligt de focus op het
samenstellen van een agenda
met specifieke actiethema's.
Ook jonge onderzoekers komen
dan aan het woord.
|
|
|
|
| 6-8
april 2016 - EGI Conferentie 2016
in Amsterdam ⇒
|
|
De EGI Conferentie 2016
heeft dit jaar als thema
"Het opengooien van de
wetenschap in Europa en
wereldwijd". De conferentie
vindt plaats tussen 6 en 8
april 2016 aan het Science
Park in Amsterdam. Deze
editie zal
onderzoeksgemeenschappen,
NGIs en EIROs, en
samenwerkende
e-Infrastructuren in de
kijker plaatsen als
belangrijke spelers in het
aanbieden van digitale
diensten voor wetenschap
over de grenzen heen.
Deelnemers zullen ontdekken
hoe diensten zoals
geavanceerde computing,
opslag, gegevensbeheer en
AAI - als ze interoperabel
zijn en geintegreerd met
specifieke diensten voor de
gemeenschap zoals
gegevensreeksen, software en
instrumenten, oplossingen
met meerwaarde kunnen
opleveren voor de
onderzoekssamenwerkingsverbanden
van gelijk welke schaal, van
long tail initiatieven in de
wetenschap tot
internationale
onderzoeksprojecten. U kunt
zich tot en met 1 april
inschrijven voor deze
conferentie.
|
|
|
|
| 10-12
mei 2016 - PRACEdays16 in Praag,
Tsjechische Republiek →
|
|
PRACEdays16 zal plaatsvinden
tussen 10 en 12 mei 2016 in
Praag, Tsjechische
Republiek. De registratie
werd op 15 februari 2016
geopend en sluit af op 29
april 2016. Een speciale
hotelprijs in Orea Pyramida
Hotel waar ook de
conferentie wordt gehouden
is beschikbaar tot en met 10
maart 2016. Voor de
conferentie zelf betaalt
elke deelnemer 60 euro. Het
PRACEdays16 programma volgt
de traditionele weg zoals
voor de edities van 2014 en
2015. Het bestaat uit
internationale keynote
presentaties van
wetenschappers van topniveau
en onderzoekers uit de
academische wereld en het
bedrijfsleven, onder wie
Sharon Broude Geva,
Directeur van Advanced
Research Computing (ARC) aan
de Universiteit van
Michigan, Verenigde Staten;
Christoph Guembel, Directeur
Virtual Vehicle bij Porsch
AG in Duitsland; en Martin
Winter van de European
Chemical Industry Council.
Op 11 mei krijgen 12
wetenschappers en 6
industriele onderzoekers de
kans in 18 parallelle
sessies om hun werk voor te
stellen en in gesprek te
gaan met het publiek. Op de
laatste dag vindt er een
afsluitend panel plaats dat
gemodereerd wordt door Tom
Wilkie van Scientific
Computing World. Een
postersessie en een cocktail
receptie, een Open Sessie
van het PRACE User Forum,
een netwerkdiner, en
verschillende
prijsuitreikingen zullen dit
driedaagse event
vervolledigen.
|
|
|
|
| 17-28
juli 2016 - 2016 CSCS-USI
Zomerschool in Ticino,
Zwitserland →
|
|
Het Nationale Supercomputing
Center in Zwitserland (CSCS)
organiseert de CSCS-USI 2016
Zomerschool met als thema
"Effective High Performance
Computing" die plaatsvindt
van 17 tot en met 28 juli
2016 in Hotel Serpiano in
Ticino, Zwitserland. De
Zomerschool gaat over de
effectieve exploitatie van
HPC systemen. Traditionele
parallelle
programmeerbenaderingen
gebaseerd op het
message-passing paradigma
volstaan niet langer om deze
taak te vervullen en
innoverende oplossingen
dienen gezocht te worden.
Tijdens de twee weken van de
zomerschool worden een
aantal van die oplossingen
voorgesteld. De MPI, OpenMP,
CUDA, OpenACC
programmeermodellen worden
geintroduceerd, samen met
wetenschappelijke
bibliotheken en efficiente
I/O oplossingen. Hun
effectief gecombineerd
gebruik om een ideale
exploitatie te bereiken van
grote hybride architecturen,
zal besproken worden. Er
wordt geexperimenteerd met
extensieve praktische en
oefensessies om het
theoretische materiaal te
toetsen. Master en Ph.D
studenten kunnen zich
kandidaat stellen voor deze
zomerschool tot en met 11
april 2016.
|
|
|
|
|
|
|
Ledennieuws |
|
|
| Innovatieve
ideeen welkom voor de Amsterdam
Science & Innovation Award
2016 ⇒
|
|
U kunt kans maken op 10.000
euro met een innovatief idee
met commerciele en
maatschappelijke relevantie.
Onderzoekers, medewerkers en
studenten van de Amsterdamse
universiteiten en
hogescholen, academische
ziekenhuizen en publieke
onderzoekscentra kunnen
meedingen naar de Amsterdam
Science & Innovation
Award 2016. Deelname aan de
Amsterdam Science &
Innovation Award is een
uitstekende gelegenheid om
een idee verder uit te
werken en de impact ervan te
onderzoeken. De jury, onder
voorzitterschap van
Alexander Rinnooy Kan,
selecteert tien finalisten
op basis van innovativiteit,
uitvoerbaarheid en
vervulling van een
marktbehoefte. De finalisten
krijgen ter voorbereiding op
de finale een professionele
pitchtraining en
ondersteuning van de
business developers van
Innovation Exchange
Amsterdam (IXA). Ook bestaat
de mogelijkheid om, tijdens
het Science meets Business
programma, in contact te
komen met bedrijven en
organisaties uit de publieke
sector. Dit is een nieuw
programma onderdeel van de
Innovation Award. U kunt uw
voorstel indienen tot en met
11 maart 2016. De prijs
wordt feestelijk uitgereikt
op 26 mei 2016.
|
|
|
|
| Spelen
met systemen tijdens workshop op
HPC Cloud ⇒
|
|
Tijdens een workshop over
translationele
onderzoeksinfrastructuren -
infrastructuur voor een
efficiente vertaling van
medische
onderzoeksresultaten naar
praktische toepassingen -
werd de HPC Cloud van
SURFsara gebruikt om elke
deelnemer toegang te bieden
tot zijn eigen virtuele
machine en flexibel te zijn
ten aanzien van het aantal
deelnemers. Het hebben van
hun eigen virtuele machine
gaf de deelnemers volledige
vrijheid om met de systemen
te spelen. Door de machines
op de HPC Cloud te laten
draaien konden de
workshopleiders veeleisende
tutorials maken wat betreft
geheugen en CPU-gebruik. De
workshop werd gezamenlijk
georganiseerd door Stefan
Klein van Euro-Bioimaging,
Erasmus MC; Morris Swertz
van BBMRI, UMCG; en Freek de
Bruijn van EATRIS, VUmc en
NKI, tijdens het
BioMedBridges symposium
'Open bridges for life
science data' op 17-18
november 2015 in Hinxton,
Verenigd Koninkrijk. De
bijeenkomst bood een
hands-on kennismaking met de
IT-infrastructuur voor
translationeel biomedisch
onderzoek, waaronder de
'bruggen' - gedeelde
e-infrastructuur - die
gezamenlijk zijn gebouwd
binnen het BioMedBridges
project. Deze bruggen
stellen medische
onderzoekers in staat
imaging-, moleculaire en
klinische data te delen,
gebruiken, beheren en
combineren, inclusief
biosamples: het doorzoeken
van biobanken om monsters en
gerelateerde gegevens te
vinden die relevant zijn
voor hun onderzoek.
|
|
|
|
| Betere
doorvoersnelheid sensornetwerken
met wiskunde →
|
|
Promovendus Martijn
Onderwater van CWI en VU
optimaliseerde met
wiskundige technieken de
doorvoersnelheid in ZigBee
sensornetwerken. Dit is
belangrijk omdat er steeds
meer sensoren komen en de
netwerken voller worden.
Daarnaast combineerde hij
beslismodellen voor onzekere
omstandigheden met
technieken uit de
kunstmatige intelligentie.
Dit resulteerde in een
veelbelovende nieuwe
techniek, waardoor
sensornetwerken kunnen
bijdragen aan betere
beslissingen, zoals het
kiezen van de beste
nooduitgang. De onderzoeker
van het het Centrum Wiskunde
& Informatica (CWI)
promoveerde op 8 februari
2016 aan de Vrije
Universiteit op zijn
proefschrift 'Network of
Sensors - Operations and
Control'. |
|
|
|
| Vici-subsidies
voor baanbrekend kwantumonderzoek
en ander natuurkundig onderzoek →
|
|
32 wetenschappers ontvangen
een Vici-beurs van anderhalf
miljoen euro van NWO. De
financiering is bedoeld om
de komende 5 jaar onderzoek
te doen en een eigen
onderzoeksgroep op te
bouwen. Vici is een van de
grootste persoonsgebonden
wetenschappelijke premies
van Nederland en is
onderdeel van de
Vernieuwingsimpuls van NWO.
De Vici-beurzen worden door
NWO wetenschapsbreed
toegekend. De laureaten doen
onder andere onderzoek naar
de evolutie van sterren, het
schizofrene gedrag van
elektronen, naar leptonen,
naar een computationele
Ideeengeschiedenis, naar
herhaling in complexe
stelsels van niet lineaire
vergelijkingen om te komen
tot efficientere
data-analyse, naar
Internetten met
kwantummechanica zodat
afluisteren onmogelijk
wordt, en naar hoe men van
neutronenster naar
kwantumcomputer komt. Binnen
Vici zijn onderzoekers vrij
om hun eigen
onderzoeksproject voor te
dragen voor financiering.
Voor de ronde van 2015
dienden bij de
vooraanmelding in totaal 215
wetenschappers een voorstel
in. 122 aanvragers hebben
een uitgebreide aanvraag
ingediend. Daarvan zijn er
nu 32 toegewezen, wat
neerkomt op een
toekenningspercentage van
ongeveer 15 procent. Het
toekenningspercentage onder
de vrouwen is 17%, onder de
mannen is dat 14%. |
|
|
|
| eScience
Center treedt toe tot OpenDA
Associatie ⇒
|
|
Een van de doelstellingen
van het eScience Center is
om actief bij te dragen tot
het hergebruik van
wetenschappelijke software
en dit ook te promoten.
Daarom is het eScience
Center nu toegetreden tot de
OpenDA associatie. OpenDA is
een open interface standaard
voor en de vrije toepassing
van een reeks tools om
gegevensassimilatie en
calibratie voor arbitraire
numerische modellen snel uit
te voeren. OpenDA wil het
gebruik van
gegevensassimilatie en
calibratie stimuleren door
de kosten van uitvoering te
verminderen en de
uitwisseling van software
tussen onderzoekers en
eindgebruikers te verhogen.
Met deelnemers van
universiteiten,
onderzoeksinstituten en
bedrijven die met dezelfde
tools werken, kunnen nieuwe
ontwikkelingen snel
overgebracht worden van
onderzoek naar toepassing.
Enkele van de OpenDA
toepassingen zijn het
traceren van wolken van
vulkaanuitbarstingen, het
verbeteren van de
accuratesse om
overstromingen van rivieren
en kustgebieden te
voorspellen, en het
verbeteren van grondwater
voorspellingen. Bij het
eScience Center gebruikt men
OpenDA als deel van het
eWaterCycle project waarvoor
de onderzoekers een
wereldwijd hydrologisch
waarschuwingssysteem hebben
ontworpen. Het eScience
Center vervoegt stichtende
OpenDA leden VORTech,
Deltares en TU Delft,
alsmede andere nieuwe leden
zoals DHI en TNO. Met deze
nieuwe leden groeit de
associatie nu snel aan tot 6
leden. Dit betekent een
belangrijke simulans voor
het verbreden van de
doelstellingen van OpenDA.
Men hoopt dat OpenDA
gebruikt gaat worden in
nieuwe domeinen en projecten
in de nabije toekomst.
|
|
|
|
| SURFnet
neemt eerste internationale
terabitverbinding in productie ⇒
|
|
Op 21 januari heeft SURFnet
voor het eerst een
internationale netwerklink
met een capaciteit van meer
dan 1 terabit per seconde in
productie genomen. Dit is
een mijlpaal, omdat bij
snelheden hoger dat 1 Tbit/s
het gedrag van glasvezel en
optische versterkers nog
kritischer wordt. Op deze
Cross Border Fiber tussen
Amsterdam en Hamburg
transporteert SURFnet nu
data met een maximale
capaciteit van 1,06 terabit
per seconde. Naast de
capaciteit voor SURFnet
zelf, is een groot deel van
deze capaciteit
geimplementeerd met het
Alien wave-concept. Hiermee
kunnen de glasvezelkabel en
de optische systemen gedeeld
worden met het Europese
onderwijs- en
onderzoeksnetwerk GEANT en
de netwerken van NORDUnet in
Scandinavie en PSNC in
Polen. De glasvezelkabel
heeft een lengte van 644
kilometer en is in Amsterdam
gekoppeld aan het
SURFnet-netwerk, maar ook
met 2 andere Cross Border
Fibers naar Geneve en
Londen. |
|
|
|
| Huib
Bakker nieuwe directeur
FOM-instituut AMOLF →
|
|
Prof.dr. Huib Bakker is per
1 februari 2016 benoemd tot
directeur van FOM-instituut
AMOLF. Hij volgt
AMOLF-directeur Vinod
Subramaniam op, die sinds
september 2015 rector
magnificus van de Vrije
Universiteit Amsterdam is.
Bakker was vanaf 1 september
2015 al interim-directeur en
kent AMOLF goed: hij is er
gepromoveerd en is sinds
2003 hoofd van de afdeling
moleculaire nanofysica. Hij
is een fysicus met een
brede, multidisciplinaire
blik en werkt veel samen met
bedrijven. Bakker is
hoogleraar aan de UvA en
sinds 2015 lid van de KNAW.
Huib Bakker (1965) is
wereldwijd bekend als expert
in het onderzoek van de
eigenschappen van water in
wisselwerking met ionen,
(bio)moleculen, en
oppervlakken. Deze
interacties spelen een
cruciale rol in vele
biologische en chemische
systemen, bijvoorbeeld in de
vouwing van eiwitten en in
het transport van ionen
langs en door membranen.
Bakker ontwikkelde speciale
niet-lineaire
spectroscopische technieken
waarmee het mogelijk is om
de beweging en structuur van
water in dit soort complexe
systemen te bepalen. De
nieuwe inzichten die hij
daarmee verkreeg vinden
toepassingen in de
voedingsindustrie,
energieopslag en
waterzuivering.
|
|
|
|
| Zwaartekrachtsgolven
gedetecteerd 100 jaar na Einsteins
voorspelling →
|
|
Wetenschappers hebben voor
het eerst rimpelingen in de
ruimtetijd, zogeheten
zwaartekrachtsgolven,
waargenomen. Deze
zwaartekrachtsgolven
arriveerden op aarde
afkomstig van een extreem
heftige gebeurtenis in het
heelal. Deze eerste meting
van zwaartekrachtsgolven
bevestigt een belangrijke
voorspelling van Albert
Einsteins algemene
relativiteitstheorie uit
1915 en opent een nieuw
venster op de kosmos.
Zwaartekrachtsgolven
bevatten informatie over hun
turbulente oorsprong en over
de aard van zwaartekracht,
die op geen andere manier
kan worden verkregen.
Natuurkundigen hebben
geconcludeerd dat de
gedetecteerde
zwaartekrachtsgolven zijn
ontstaan in de laatste
fractie van een seconde van
de samensmelting van twee
zwarte gaten, waardoor 1
enkel, zwaarder, tollend
zwart gat ontstond. De
samensmelting van twee
zwarte gaten was tot nu toe
alleen voorspeld, maar nooit
waargenomen. De
zwaartekrachtsgolven zijn op
14 september 2015 om 10.51
uur Nederlandse tijd
gedetecteerd door beide
Laser Interferometer
Gravitational-wave
Observatory (LIGO)
detectoren, in Livingston,
Louisiana en Hanford,
Washington in de Verenigde
Staten. De LIGO-observatoria
worden gefinancierd door de
Amerikaanse National Science
Foundation (NSF). Ze zijn
ontworpen en gebouwd en
worden gerund door Caltech
en MIT. Nederlandse
wetenschappers zijn nauw
betrokken bij deze
baanbrekende ontdekking. Als
leden van de 'LIGO
Scientific Collaboration -
Virgo Collaboration' (LVC)
hebben natuurkundigen van
het Nationaal instituut voor
subatomaire fysica (Nikhef)
en de Vrije Universiteit
Amsterdam, en
sterrenkundigen van de
Radboud Universiteit
cruciale bijdragen geleverd
aan de validatie van de
meting, de data-analyse van
deze zwaartekrachtsgolven,
en meegewerkt aan de
astrofysische interpretatie.
|
|
|
|
| 3D-Archeologie
in Rome voorgesteld op het Eureka!
Festival →
|
|
Op 29 november 2015
presenteerden archeologen
van de Radboud Universiteit
Nijmegen en onderzoekers van
het Spatial Information
Laboratory (SPINlab) van de
Vrije Universiteit
Amsterdam, samen met
medewerkers van Fugro
GeoServices en informatici
van het Netherlands eScience
Center het 3D GIS voor het
Mapping the Via
Appia-project op het Eureka!
Festival. Het evenement werd
georganiseerd ter ere van de
presentatie van de Nationale
Wetenschapsagenda en was
bedoeld om het Nederlandse
publiek kennis te laten
maken met lopend
wetenschappelijk onderzoek.
Het festival vond plaats in
de Westergasfabriek te
Amsterdam en trok ongeveer
tweeduizend bezoekers. In
een samenwerking tussen
archeologen, geodeten en
informatici is een
onderzoeksinstrument
ontwikkeld dat de
archeologen in staat stelt
hun onderzoeksgebied - een
deel van de vijfde en de
zesde mijl vanaf het centrum
van Rome - in een virtuele
3D-omgeving (3D GIS) te
analyseren. De Via Appia,
ook wel bekend als de
koningin der wegen of eerste
"snelweg" van Europa, stamt
uit de vierde eeuw voor
Christus en gold in de
oudheid als de belangrijkste
weg vanaf Rome richting
Zuid-Italie. In de Romeinse
tijd was het gebruikelijk de
doden buiten de stad, langs
de uitvalswegen, te
begraven. Aangezien Rome
lang het centrum van de
antieke wereld is geweest en
de Via Appia dus een van de
belangrijkste wegen was,
hebben we te maken met een
archeologisch zeer rijk
gebied met tal van restanten
van vaak bombastische
grafmonumenten. Het doel van
"Mapping the Via Appia" is
om te reconstrueren hoe de
verschillende structuren er
in het verleden uit hebben
gezien en hoe het aanblik
van de weg in de loop van de
tijd is veranderd. Een van
de grootste uitdagingen
binnen het project is om van
al deze verspreide
brokstukken en ruines -
ongeveer drieduizend in
totaal - betrouwbare
reconstructies te maken. De
archeologen verzamelen
hiervoor allerlei
gedetailleerde informatie
zoals het type steen, de
datering, decoratie en
mogelijke inscripties. Al
deze informatie is
opgeslagen in een database
en nu te bevragen in een
virtuele 3D-omgeving: het 3D
GIS. Met het 3D GIS hebben
de archeologen nu een
analyse-tool waarmee ze
ruimtelijke vragen kunnen
stellen op een manier die
eerder niet mogelijk was.
Voor het inmeten van het
studiegebied in 3D is de
hulp ingeschakeld van Fugro
GeoServices. Met Fugro's
DRIVE-MAP-systeem is het
onderzoeksgebied in minder
dan een uur met een extreme
nauwkeurigheid als
3D-puntenwolk geregistreerd.
Omdat het DRIVE-MAP-systeem
naast een panoramacamera,
hoge resolutiecamera's en
laserscanners een
GNNS-ontvanger met precieze
standsbepalingsensor heeft,
is de 3D-puntenwolk
eenvoudig te relateren aan
het aardoppervlak. De
DRIVE-MAP-dataset is
vervolgens aangevuld met
3D-modellen gegenereerd door
de range-image-techniek
Structure-from-Motion (SfM).
Simpel gezegd genereert deze
techniek 3D-objecten op
basis van patronen in
foto's.
|
|
|
|
| Onderzoek
zwaartekrachtsgolven leidt tot
commerciele toepassingen →
|
|
Terwijl de betrokken
wetenschappers en de
wereldwijde collaboratie van
zwaartekrachtsgolvenonderzoek
waartoe zij behoren nog
bijkomen van de monumentale
ontdekking van 11 februari,
is 1 ding zeker: deze
detectie is nog maar het
begin van een heel nieuw
vakgebied binnen de
astronomie en een tool om
het universum en haar inhoud
beter te begrijpen. Hoewel
de ontdekking van
fundamentele aard is, leidt
de technologie tot concrete
applicaties die nu al in
gebruik worden genomen.
Innoseis, een spin-off
bedrijf van Nikhef, heeft
een baanbrekende commerciele
toepassing ontwikkeld om
minuscule seismische
trillingen waar te nemen.
Innoseis wordt gezien als
een uitstekend voorbeeld van
hoe fundamenteel
natuurkundig onderzoek kan
leiden tot commerciele
toepassingen en industriele
samenwerking om oplossingen
te vinden voor hedendaagse
problemen. De ontwikkelde
technologie stamt af van het
onderzoek naar
zwaartekrachtsgolven dat
plaats vond op Nikhef, het
Nationaal instituut voor
subatomaire fysica. Innoseis
co-founder prof. Jo van den
Brand wordt veel geciteerd
in de media vanwege zijn
aanzienlijke bijdragen in
dit vakgebied. Daarnaast
heeft hij ook de
prestigieuze FOM valorisatie
prijs gewonnen voor zijn
inzet om fundamentele kennis
tot in de praktijk toe te
passen.
|
|
|
|
| MinE
project doet aan totale genoom
sequencing met gebruik van HPC
clusters om middel tegen ALS te
vinden →
|
|
Tijdens het SURFsara Super D
Event van afgelopen december
in Felix Meritis te
Amsterdam, hadden we een
gesprek met Jan Veldink,
neuroloog en professor in
neurogenetica aan het
Universitair Medisch Centrum
(UMC) in Utrecht over de
ziekte van Lou Gherig, beter
gekend als ALS. Jan Veldink
coordineert het MinE
project, een groot genoom
sequencing project voor ALS.
ALS is een ernstige ziekte
die in een tijdspanne van 3
tot 5 jaar dodelijk kan
aflopen en die vooral
voorkomt bij mensen van over
de zestig. Jongere mensen
kunnen er echter ook het
slachtoffer van worden.
Momenteel bestaat er geen
remedie. Onderzoekers hebben
daarom dringend nood aan
meer inzicht in de oorzaken
om hopelijk nieuwe
behandelingen te vinden.
|
|
|
|
| Instellingen
praten over netwerktrends tijdens
drukbezocht Netwerkcafe →
|
|
Waaraan werken instellingen
op netwerkgebied? En hoe
sluiten nieuwe diensten van
SURFnet hierop aan? En welke
wensen hebben instellingen
nog meer? Dit stond centraal
tijdens het drukbezochte
Netwerkcafe op 28 januari
2016. Robert Vos van het
Deltion College vertelde
over het implementeren van
Software Defined Networking
(SDN) in hun netwerk.
Deltion loopt hiermee
voorop, en uit de reacties
uit de zaal bleek dat het
voor de meeste instellingen
ook gaat spelen in de
komende jaren, met name als
het om datacenters gaat.
Paula de Nie van de
Universiteit Leiden stelde
bijvoorbeeld: "Wij zijn
bezig met een nieuw
datacenter en daarbij kunnen
we eigenlijk niet om SDN
heen. We kijken wel of we
klein kunnen beginnen, als
pilot, bijvoorbeeld met
onderzoekers." Een ander
onderwerp dat reacties
opriep, zijn
maatwerkvoorzieningen voor
onderzoekers. Gerard
Verwoolde van de Hogeschool
Utrecht, stelde:
"Onderzoekers blijken alles
te gebruiken wat God
verboden heeft. Daarom
hebben we SURFnet gevraagd
ons te helpen met het in
kaart brengen van ICT-wensen
van onderzoekers. En hoe we
daar in onze
standaardomgeving voor
eindgebruikers beter op
kunnen inspelen." Ook voor
andere instellingen speelt
dit. Zo vertelde Rob
Cornelisse van LUMC over hun
Research LAN: Met behulp van
het SURFnet E-LAN kunnen
onderzoekers directe, snelle
netwerkverbindingen tussen
verschillende
onderzoeksinstellingen
realiseren. Zo kunnen
wetenschappers makkelijk en
veilig gegevens delen. De
onderzoekers beschikken
daarnaast over rekenkracht,
omdat SURFsara ook
aangesloten is.
|
|
|
|
| Verdere
uitbreiding nationale Bull
supercomputer in 2016 →
|
|
SURFsara breidt in de tweede
helft van 2016 de capaciteit
van de nationale
supercomputer Cartesius uit.
Het contract met leverancier
Atos is in december
getekend. De modellen
waarmee onderzoekers werken,
worden steeds complexer en
de datasets groter, waardoor
zij meer rekencapaciteit
nodig hebben. De Bull
supercomputer van SURFsara
wordt gebruikt voor
wetenschappelijk onderzoek
door universiteiten,
onderzoeksinstituten en in
beperkte maar toenemende
mate door het bedrijfsleven.
Cartesius wordt onder andere
ingezet voor
klimaatonderzoek,
watermanagement, verbeteren
van medische behandelingen,
onderzoek naar schone
energie, beperken van
geluidshinder en product- en
procesoptimalisatie.
Cartesius wordt uitgerust
met de nieuwe
sequana-technologie van
Bull. Daarnaast zal de
supercomputer de laatste
Intel-processors (Broadwell)
krijgen, en EDR InfiniBand.
De snelheid van de computer
wordt hiermee uitgebreid met
260 Tflops/s tot in totaal
1,8 Pflops/s. Het voordeel
van dit nieuwe type nodes is
dat het systeem hiermee
toekomstbestendig is en kan
worden uitgebreid met de
laatste technologie op het
gebied van processors,
accelerators en
interconnect.
|
|
|
|
| Training
introduceert postgraduaat
studenten van domeindisciplines
tot gegevensintensief onderzoek →
|
|
Tussen 25 en 29 januari 2016
vond in Utrecht de eerste
editie plaats van de
"Essential Skills in
Data-Intensive Research"
workshop. Deze training is
een gezamenlijke inspanning
van het eScience Center,
SURFsara, het Dutch
Techcenter for Life Science
(DTL), de Vrije Universiteit
Amsterdam en de Software en
Data Carpentry Stichting. De
training is voornamelijk
gericht op prille
onderzoekers en PhD
studenten maar kan ook zeer
relevant zijn voor een
wetenschapper in een
meergevorderd stadium van
zijn/haar carriere. De
vijfdaagse workshop met
inbegrip van hands-on en
theoretische componenten, is
ontworpen om postgraduaat
studenten van
domeindisciplines kennis te
laten maken met het gebruik
van gegevensgerichte en veel
rekenkracht vereisende
benaderingen en de
potentiele toepassingen van
e-infrastructuur. De cursus
die direct volliep, trok
zo'n 30 deelnemers aan
vanuit heel Nederland -
Groningen, Wageningen,
Twente, Amsterdam, Leiden en
Utrecht - en vanuit
verschillende gebieden -
life science,
klimaatonderzoek en
natuurkunde. De cursus werd
gegeven in de uitstekend
ingerichte faciliteiten van
SURFacademy in de kantoren
van SURF in Hoog Overborch,
Utrecht.
|
|
|
|
| CWI
spin-off MonetDB Solutions bouwt
mee aan het ExaNeSt platform ⇒
|
|
In een nieuw Europees
project helpt MonetDB
Solutions mee aan het
opbouwen van ExaNeSt, een
platform van de toekomstige
generatie dat bestaat uit 10
miljoen goedkope ARM
processoren met lage
energie. De taak van de CWI
spin-off is om het platform
te evalueren aan de hand van
extreme rekenkracht vergende
toepassingen in het
analyseren van big data. Het
complete prototype zal
vermoedelijk klaar zijn in
2018. Het ExaNeSt consortium
bestaat uit 12 partners die
gesubsidieerd worden via het
Horizon2020 initiatief van
de Europese Commissie. Elke
partner afzonderlijk heeft
expertise in een
sleuteltechnologie die nodig
is voor de innovatie om
exascale rekenkracht te
bereiken. Zo brengt MonetDB
Solutions de kennis aan van
meer dan 30 jaar onderzoek
naar databases en
industriele praktijken,
aldus Martin Kersten, de
co-stichter en CEO van
MonetDB Solutions. Via het
open source zuilvormige
database systeem MonetDB,
wil MonetDB Solutions de
toepasbaarheid aantonen van
het ExaNeSt platform voor
een brede waaier aan
toepassingen van Business
Intelligence en Big Data die
extreme rekenkracht
vereisen.
|
|
|
|
| Kandidaturen
ingewacht voor de Nederlandse
Dataprijs →
|
|
Ook dit jaar wordt de
Nederlandse Dataprijs
uitgereikt door Research
Data Netherlands, een
samenwerking tussen
3TU.Datacentrum, DANS en
SURFsara. Deze prijs gaat
naar een onderzoeker of
onderzoeksgroep die extra
bijdraagt aan de wetenschap
door onderzoeksdata
beschikbaar te maken voor
aanvullend of nieuw
onderzoek. Bent of kent u
zo'n onderzoeker met een
goed voorbeeld van gedeelde
data? U kunt uzelf of een
ander binnenkort via de
website van Research Data
Netherlands nomineren. Dit
jaar worden prijzen
uitgereikt in drie
categorieen: 1) humaniora en
sociale wetenschappen, 2)
exacte en technische
wetenschappen en 3) medische
en levenswetenschappen. De
winnaars ontvangen een beeld
en 5.000 euro om de dataset
toegankelijk(er) te maken,
bijvoorbeeld door een
symposium te organiseren of
de data online te
ontsluiten. De
prijsuitreiking is op 9
november bij NWO in Den
Haag. Aanmelden kan
binnenkort online.
|
|
|
|
| Sneller
toegang tot grote rekensystemen ⇒
|
|
Steeds meer instellingen
kiezen ervoor om
onderzoekers direct toegang
te geven tot de nationale
rekensystemen LISA en
Cartesius. Naast de UvA en
de VU bieden nu ook de EUR,
TU Delft en Tilburg
University hun onderzoekers
toegang tot deze grote
computersystemen via
rekenbundels op SURFsara's
Research Capacity Computing
Service (RCCS). Voor
onderzoekers is het nu nog
gemakkelijker om te rekenen
op het LISA Rekencluster en
de nationale supercomputer
Cartesius van SURFsara. Waar
zij voorheen alleen toegang
konden krijgen via een
NWO-aanvraag, is het nu
mogelijk om deze rekenkracht
aan te vragen via de
centrale ICT-afdeling van de
instelling. Inmiddels hebben
5 universiteiten een
RCCS-contract afgesloten.
Hiermee bevordert de
universiteit het gebruik van
de meest geavanceerde
nationale high performance
computing (HPC)-diensten en
kunnen onderzoekers snel aan
de slag. De vraag naar
rekenkracht in onderzoek is
aanzienlijk door een
groeiende hoeveelheid data
waarvoor analyses nodig
zijn, en door toenemende
mogelijkheden voor
simulaties. Afhankelijk van
de hoeveelheid data en de
benodigde rekenkracht kunnen
onderzoekers kiezen voor het
LISA Rekencluster of het
super capability systeem
Cartesius. Om onderzoekers
op weg te helpen met de
systemen, geeft SURFsara
trainingen en cursussen op
locatie. De meeste
onderzoekers zijn gewend om
te werken op Windows of Mac
operating systemen. Een
introductie in Unix en in
het gebruik van clusters is
de eerste stap naar het
opschalen van het rekenwerk
op de eigen laptop of het
plaatselijke (kleine)
cluster.
|
|
|
|
| Volledig
geintegreerde 3D tomografie met
nieuwe generatie van algoritmes en
hoog presterende scanners en GPU
clusters ligt in het verschiet →
|
|
Tijdens het SURFsara Super D
Event van afgelopen december
in Felix Meritis te
Amsterdam, spraken we met
Joost Batenburg van het
Centrum Wiskunde &
Informatica - CWI over 3D
tomografie. Joost Batenburg
is een onderzoeker bij het
CWI in Amsterdam en een
part-time professor aan het
Wiskundig Instituut van de
Universiteit van Leiden.
Zijn onderzoeksgebied is
tomografie, een vorm van 3D
beeldreconstructie vanuit
projecties. Het meest
gekende voorbeeld van
tomografie is een medische
CT scanner waar X-ray
beelden worden opgenomen
vanuit een groot aantal
verschillende hoeken rond de
patient. De techniek bestaat
eruit om als input de reeks
X-ray beelden te nemen en
daaruit een 3D beeld te
berekenen van hoe de patient
er van binnen uitziet. Men
kan deze techniek niet
alleeen voor medische
beeldverwerking gebruiken
maar ook om binnen
nanostructuren te kijken van
beelden met gebruik van een
elektronenmiscroscoop, voor
niet-destructieve tests, om
een reeks van industriele
objecten te bekijken, en
voor een brede waaier van
andere toepassingen.
|
|
|
|
| Tata
Steel opent vestiging Amsterdam
Science Park →
|
|
Burgemeester Van der Laan
van Amsterdam opende op 29
januari 2016 een vestiging
van Tata Steel op het
Amsterdam Science Park. Tata
Steel zet in op het creeren
van staal met een hogere
toegevoegde waarde voor zijn
klanten door het inzetten
van kunstmatige
intelligentie ('artificial
intelligence'). Op het
Amsterdam Science Park gaan
onderzoekers van Tata Steel
samenwerken met innovatieve,
hightech start-ups om via
digitale innovaties als
kunstmatige intelligentie
nieuwe technieken te
ontwikkelen en implementeren
om nog hogere kwaliteiten
staal te kunnen maken.
Inmiddels is een project
gestart met het aldaar
gevestigde bedrijf Scyfer -
een spin-off van de
Universiteit van Amsterdam,
gericht op het verbeteren
van inspectietechnieken voor
de oppervlaktekwaliteit van
staal. |
|
|
|
|
|
|
Jobcorner |
|
|
| MdS/IDRIS
in Frankrijk zoekt
wetenschappelijk programmeur ⇒
|
|
Het Maison de la Simulation
(MdS) en het Institut du
Developpement et des
Ressources en Informatique
Scientifique (IDRIS) werven
een wetenschappelijk
programmeur aan voor 2 jaar
om te werken bij IDRIS in
Orsay. Deze positie hangt
samen met het EINFRA-5 E-CAM
Centre of Excellence zoals
beschreven in het E-CAM
subsidie-akkoord no. 676531
met inbegrip van de
bijlagen, en specifiek met
de rol van de CNRS partner
en van de FR-IDF CECAM Node
die erin beschreven staat.
De onderzoeker zal
rapporteren aan de
wetenschappelijke
hoofdcontactpersoon bij
MdS/IDRIS, in samenwerking
met de E-CAM software
manager in Juelich. De
succesvolle kandidaat krijgt
de gelegenheid om te werken
aan wetenschappelijke en
industriele problemen in een
omgeving die individueel
initiatief en actieve
professionele ontwikkeling
stimuleert en die
overeenkomt met de
standaarden van het Europees
Charter voor Onderzoekers. |
|
|
|
| eScience
zoekt Science-policy Officer ⇒
|
|
Het eScience Center werft
een Science-policy Officer
aan. In samenwerking met het
management team, zal de
Science-policy Officer de
missie, visie en strategie
ontwikkelen en evalueren en
waken over het in praktijk
brengen hiervan. De
succesvolle kandidaat zal
betrokken worden bij het
ontwikkelen en ontwerpen van
de jaarlijkse plannen en de
uitvoering hiervan evalueren
gebaseerd op de strategie.
Tevens zal hij/zij nieuwe
richtingen verkennen van
gegevensgericht en
rekenkrachtintensief
onderzoek en de toepassingen
ervan in verschillende
wetenschappelijke domeinen.
Dit gebeurt door interactie
met onderzoekers in
verschillende
wetenschappelijke domeinen
zoals de e-Integrators, met
relevante partnerinstituten
zoals NWO en met
e-infrastructuur partners
zoals SURF. De
Science-policy Officer volgt
nationale en internationale
wetenschappelijke
onderzoeksontwikkelingen en
beleidsrichtingen op.
Hij/zij adviseert het
management team over
toekomstige wegen en
strategische samenwerkingen.
U kunt solliciteren voor
deze vacature tot en met 21
februari 2016.
|
|
|
|
| Johannes-Gutenberg
Universiteit Mainz zoekt PhD
student of
postdoctoraatsonderzoeker voor de
HPC groep ⇒
|
|
Het Instituut voor
Computerwetenschappen aan de
Johannes-Gutenberg
Universiteit Mainz heeft een
vacature voor een
postdoctoraatsonderzoeker in
de groep van Professor
Bertil Schmidt. De
succesvolle kandidaat zal
meewerken aan het ontwerpen
en uitvoeren van parallelle
algoritmes voor
verschillende architecturen
zoals CUDA-gebaseerde GPUs
en CPU clusters en dit voor
wetenschappelijke
toepassingen zoals
bioinformatica,
computationele natuurkunde
en big data. De kandidaat
zal nauw samenwerken met
andere projectpartners,
wetenschappelijke papers
schrijven en tutorials
geven. Startdatum is
voorzien midden 2016.
|
|
|
|
|
|