Gelezen, Commentaar.

Staan er ook nu geen dingen in eigenlijk niets met Grids of HPC van doen hebben? Eerste stukje Twente en het film verhaal.

Jan

----- Original Message ----- From: "Gridforum.nl Nieuwsbrief" redactie@gridforum.nl To: "Gridforum.nl Bestuur" gridforum-bestuur@nikhef.nl Sent: Friday, 19 July, 2013 3:50:28 PM GMT +01:00 Amsterdam / Berlin / Bern / Rome / Stockholm / Vienna Subject: [Gridforum.nl-bestuur] Nieuwsbrief Juli 2013

L.S.

Ter informatie: het concept van de Gridforum.nl Nieuwsbrief van juli staat hieronder klaar.

Mocht er verder nog een Verenigingsactiviteit zijn die op zeer korte termijn moet worden aangekondigd dan deze graag per omgaande opsturen aub.

De Nieuwsbrief gaat aanstaande dinsdag de deur uit.

Suggesties voor de Nieuwsbrief van augustus 2013 graag uiterlijk 1 augustus naar het redactie-adres sturen.

Met vriendelijke groeten,

Leslie Versweyveld Redactie Gridforum.nl Nieuwsbrief redactie@gridforum.nl

nieuwsbrief201307 logo

Nieuwsbrief

De vereniging voor iedereen in Nederland die bezig is met of geinteresseerd is in Grid computing

Nummer juli 2013 OGF nieuws 16-18 september 2013 - OGF39 in Madrid, Spanje ⇒ Het Open Grid Forum 39 vindt samen plaats met het EGI Technical Forum en de Cloud Interoperability Week in Madrid, Spanje. Het is het derde grote event van het Open Grid Forum in 2013. De OGF39 sessies zullen worden gevolgd door de Cloud Interoperability Workshop en het Cloud Plugfest, die mede gesponsord worden door OGF in samenwerking met een aantal andere belangrijke cloud standaardisatie-organisaties, en samen met de SNIA Storage Developers Conference die gelijktiijdig wordt gehouden in Santa Clara, Californie. Samen vullen al deze events de Cloud Interoperability Week. U kunt nog voorstellen indienen voor OGF39. De registratie voor OGF39 verloopt via het EGI Technical Forum 2013. Als u van plan bent om de Cloud Interoperability Workshop of het Cloud Plugfest bij te wonen, houdt er dan rekening mee dat er een aparte no-cost registratie vereist is via http://www.cloudplugfest.org/cloud-interoperability-week/registration Cursussen en evenementen 2-3 september 2013 - Praktische introductie tot High Performance Computing in Edinburg, Schotland ⇒ Op 2 en 3 september 2013 vindt er bij EPCC aan de Universiteit van Edinburg, Schotland een praktische introductie tot HPC plaats. Na afloop van deze tweedaagse cursus heeft u een solide basis in de basisconcepten die ten grondslag liggen aan de drivers voor HPC ontwikkeling, HPC hardware, software, programmeringsmodellen en toepassingen. Deze basiskennis zal u de mogelijkheid bieden om de relevantie van HPC te waarderen in uw vakgebied en u ook uit te rusten met de tools om zelf effectief gebruik te maken van HPC-faciliteiten. De cursus bestaat uit een afwisseling van colleges en practica en heeft een zeer praktische focus. Tijdens de practica krijgt u de kans om de nationale HPC-faciliteiten te gebruiken en HPC deskundigen van het EPCC staan voor u klaar om uw vragen te beantwoorden. 9-11 september 2013 - GPU programmeren met CUDA en OpenACC in Edinburg, Schotland ⇒ Van 9 tot en met 11 september 2013 vindt er een cursus GPU programmeren met CUDA en OpenACC plaats bij het EPCC in Edinburg, Schotland. In deze 3-daagse cursus krijgt u een introductie van en hands-on ervaring met CUDA, OpenCL - met meer nadruk op het eerste - en OpenACC. In veel gevallen is het relatief eenvoudig om een code naar GPU over te brengen, maar veel moeilijker om goede prestaties te verkrijgen. Daarom worden er een reeks van gebruikelijke GPU optimalisatietechnieken behandeld. Er is geen voorafgaande HPC of parallele programmeerkennis vereist, maar deelnemers moeten wel kunnen programmeren in C, C ++ of Fortran. Toegang wordt verleend tot geschikte hardware voor alle oefeningen. 12-15 september 2013 - Science Park Film Festival ⇒ Van 12 tot en met 15 september 2013 vindt op Science Park Amsterdam de tweede editie plaats van SPAFF, het Science Park Amsterdam Film Festival. Ook Nikhef draagt bij aan het programma. SPAFF toont een 15-tal documentaires en speelfilms op het snijvlak van wetenschap en film. Stuk voor stuk films over de nieuwsgierigheid, gedrevenheid en verbeeldingskracht die kenmerkend zijn voor excellent wetenschappelijk onderzoek, onderwijs en innovatief ondernemerschap. Het programma van SPAFF 2013 staat vanaf 1 augustus online. Hier kunt ook terecht voor het reserveren van kaarten. 16-20 september 2013 - EGI Technical Forum in Madrid, Spanje ⇒ Het EGI Technical Forum wordt gehouden in Madrid, Spanje, van 16 tot en met 20 september 2013. Het event wordt gehost door EGI.eu en IBERGRID, een partnerschap tussen de Spaanse en Portugese Nationale Grid Initiatieven, dat het Iberisch schiereiland in EGI vertegenwoordigt. EGI heeft een open compute-en data-infrastructuur gebouwd door bundeling van nationale reken- en opslagcapaciteit in Europa en over de hele wereld. Het EGI Technical Forum zal zich beraden over de huidige prestaties en de koers voor toekomstige ontwikkelingen. Het forum zal zich richten op de strategische doelen van EGI voor 2020: ondersteuning van de onderzoeksgemeenschappen en onderzoekers om maatschappelijke uitdagingen aan te pakken door het gebruik van innovatieve technologie; het in productie brengen van een federatieve cloud-infrastructuur om een gediversifieerde nieuwe generatie van gebruikers te bedienen, terwijl het behoud en de verbetering van de bestaande netinfrastructuur gewaarborgd wordt; de creatie van een gemeenschap van experts die de infrastructuur gebruiken, bedienen, beheren, ontwikkelen, ondersteunen en outreach bieden; sturing van het financiele, technische en politieke bestuur van het EGI ecosysteem, zodat het blijft floreren in de komende decennia. 7 november 2013 - Eerste NL eScience Symposium in Amsterdam ⇒ Op donderdag 7 november 2013 vindt het Eerste Jaarlijkse Nederland eScience Symposium plaats in het Rosarium, Amstel Park in Amsterdam. Het event, georganiseerd door het Nederland eScience Center, zal een selectie van het toonaangevende gegevensgegenereerde onderzoek voorstellen dat wordt verricht in het hele land. De bijeenkomst is van belang voor iedereen in de academische wereld of de industrie die in contact komt met informatica, data-gedreven onderzoek, visualisatie en analyse, Big Data en de noodzaak om high-performance computers en netwerken te benutten. Case studies zullen worden gepresenteerd van een reeks wetenschappelijke disciplines en de geesteswetenschappen. Het event is gratis bij te wonen, inclusief lunch en versnaperingen. Registratie is vereist. De plaatsen zijn beperkt, dus schrijf tijdig in. Ledennieuws Universiteit Twente scoort erg goed bij Europese ICT call → Veertien projecten van UT-onderzoekers zijn gehonoreerd bij de laatste ICT-call van de Europese Unie. Met name het CTIT heeft extreem goed gescoord en haalde 5,7 miljoen euro onderzoeksfinanciering op. Het Zevende Kaderprogramma (KP7), het grootste subsidieprogramma van de Europese Unie op het gebied van onderzoek, moet internationale samenwerking tussen bedrijven en wetenschappelijke instellingen stimuleren. Via diverse 'calls' kunnen onderzoekers financiering aanvragen voor onderzoek waarbij ze nauw samenwerken met andere Europese partners. Bij de laatste ICT-call heeft de Universiteit Twente het erg goed gedaan. Veertien projecten werden gehonoreerd: twee van onderzoeksinstituut MIRA en maar liefst twaalf van het CTIT. NLeSC was gastheer voor het Nederlandse eChemistry symposium ⇒ Op 5 juli jongstleden kwamen meer dan 100 onderzoekers uit het veld van de computationele chemie samen in het hoofdkantoor van KNAW in Het Trippenhuis voor de eerste jaarlijkse Symposium over "Nederlandse Computers in Chemie" georganiseerd door NLeSC. Het symposium, georganiseerd in samenwerking met de "Chemical Design & Discovery" cursus van de Radboud Universiteit Nijmegen, werd geopend door NWO-voorzitter prof. dr. Jos Engelen, die het groeiende belang van het onderwerp en de inzet van zijn organisatie voor de verdere ontwikkeling toelichtte. Het publiek werd ook vergast op een uitstekende keynote presentatie door prof. dr. Wilfred van Gunsteren, gevolgd door sprekers uit heel Nederland die de nieuwste ontwikkelingen in hun werk presenteerden. Prof van Gunsteren, die eerder dit jaar met pensioen ging, schetste de fundamentele uitdagingen die ten grondslag liggen aan het computationeel modelleren en simulatie in de chemische wetenschappen alvorens de uitstekende selectie van sprekers de hoogtepunten van hun eigen theoretisch en toegepast onderzoek voorstelden. De vergadering die kosteloos bij te wonen was, bood een uniek beeld van de Nederlandse computationele chemie en de mogelijkheid om bestaande samenwerkingsverbanden te onderhouden en nieuwe te ontwikkelen. Nieuwe versie van Virtual Execution Platform is nu beschikbaar → Binnen het Contrail project is er een nieuwe versie uitgekomen van het Virtual Execution Platform - VEP 2.0. Het Virtual Execution Platform is een cloud middleware software die meerdere Infrastructure-as-a-Service (IaaS) clouds met elkaar verbindt. VEP beoogt het aanbieden van het volledige beheer van de IaaS cloud, terwijl de beheerders afgeschermd worden van de complexiteit van het beheer van heterogene bronnen. VEP is ontworpen om interoperabiliteit te bieden door het aanbieden van een uniforme manier om de middelen van een cloud provider voor te stellen en te beheren. VEP kan ook gemakkelijk de naadloze deelname mogelijk maken van een cloud provider aan een federatie en het voert een goede VM contextualisering en applicatie lifecycle management uit. Daarnaast publiceert VEP toepassingsevents en metrics voor het toezicht over toepassingen en de handhaving van SLA. Nederlandse start-up Lucipher wint IBM innovatiewedstrijd →

De Nederlandse start-up Lucipher heeft de innovatiewedstrijd, IBM Mentor Day, gewonnen. Met deze wedstrijd ondersteunt IBM veelbelovende softwareontwikkelaars in de Benelux die bijdragen aan IBM's Smarter Planet strategie. Door advies en coaching te geven, worden deze jonge bedrijven geholpen bij het versnellen en uitbreiden van hun bedrijf. Een jury beoordeelde de jonge Nederlandse entrepreneurs op aspecten als de toepassing van technologie, de marketingstrategie en de deskundigheid van de teamleden. Lucipher werd door een jury, met professionals uit IT, Marketing, HR, Finance en investment, uitgeroepen tot winnaar. Lucipher biedt bedrijven een veilige manier om data in de cloud op te slaan en uit te wisselen. De software versleutelt data van haar gebruikers, zodat ze gebruik kunnen maken van cloudstorage met de zekerheid dat data nooit in verkeerde handen valt. Tegelijkertijd biedt Lucipher alle voordelen van de bekende cloudstorage platformen zoals Dropbox en Google Drive. Hierdoor is het voor bedrijven makkelijk om werknemers data veilig te laten delen met elkaar en derde partijen. Tevens is het eenvoudig om Lucipher te ingreren in de bestaande IT-omgeving van bedrijven.

UvA-team genomineerd voor Academische Jaarprijs 2013 ⇒ De Academische Jaarprijs heeft tot doel wetenschap onder de aandacht te brengen van een breed publiek. Een vakjury onder voorzitterschap van Paul Schnabel, oud-directeur Sociaal Cultureel Planbureau, heeft uit zeventien inzendingen drie teams genomineerd. Het team onder leiding van Judy Shamoun-Baranes en Willem Bouten van het Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteemdynamica van de Universiteit van Amsterdam, is met het onderzoeksvoorstel 'Vogel het uit' doorgedrongen tot de finale. Het voorstel sprak de jury aan omdat het op een leuke manier een breed publiek actief wil betrekken bij het onderzoek naar vogels. 'Vogel het uit' is onderdeel van het eEcology project. Hierin werkt SURFsara, samen met de Universiteit van Amsterdam en het Netherlands eScience Center, aan het verzamelen en analyseren van vogeldata, om zo een beter inzicht te krijgen in vogelgedrag. De winnaar van de Academische Jaarprijs wordt bekend gemaakt tijdens de feestelijke finale op 23 oktober 2013. Het winnende team ontvangt 100.000 euro om het onderzoekvoorstel daadwerkelijk uit te voeren. Call for Application: PRACE introduceert SHAPE, een HPC adoptieprogramma voor kleine en middelgrote ondernemingen →

SHAPE, het MKB-HPC Adoptie programma in Europa is een pan-Europees PRACE programma. SHAPE is gericht op bewustwording en geeft het Europese MKB de nodige expertise om te profiteren van de innovatie-mogelijkheden die door High Performance Computing (HPC) geopend worden, waardoor hun concurrentievermogen vergroot. SHAPE brengt het MKB in contact met HPC-technologie voor de ontwikkeling van nieuwe producten en diensten, om de time-to-market en de kosten van R&D te reduceren of de kwaliteit van de dienstverlening te verhogen. De mogelijkheden van HPC zijn enorm en een toenemend aantal MKBs wenden zich tot HPC om nieuwe zakelijke kansen te creeren. Het MKB beschikt vaak niet over de kennis en middelen om volledig te profiteren van deze mogelijkheden. Het programma zal bijdragen aan het overwinnen van deze belemmeringen om deel te nemen aan HPC. Het zal de overdracht van technologie tussen universiteiten en de industrie bevorderen, en de definitie van een werkbare oplossing op basis van HPC en van een geschikt business model vergemakkelijken. De Call for Applications werd geopend op 17 juni 2013, met sluitingsdatum op 15 september 2013. De uiteindelijke beslissing wordt door PRACE aan de succesvolle aanvragers meegedeeld medio oktober 2013.

NLeSC onderzoeker draagt bij aan verbeterde modellering voor veiligheid op luchthavens →

In samenwerking met collega's aan de Vrije Universiteit Amsterdam en het Nederlandse Nationale Lucht- en Ruimtevaartlaboratorium (NLR) is NLeSC senior eScience engineer dr. Rob van Nieuwpoort, bezig met het toepassen van GPU-gebaseerde methoden om prestatieverbeteringen te krijgen voor de berekening van het risico van derden rond luchthavens. Het werk, dat op de 5de Internationale Conferentie over Veiligheid en Security Engineering moet worden voorgelegd in september, heeft de efficientie van het NLR Third Party Risk model verbeterd dat wordt gebruikt om het risico voor mensen die wonen en werken rond luchthavens te evalueren. Het ontwerp van nieuwe of gewijzigde vliegroutes en landingsbaan infrastructuur op luchthavens vereisen dat risicostudies voor derden worden uitgevoerd om de impact van de luchthavenomgeving bepalen. Door de toename van het verkeer, de beschikbaarheid van verbeterde individuele vlucht track data, en de behoefte aan gedetailleerde berekeningen op een dichter vluchtrooster, heeft de tijd die nodig is voor een risicoberekening sterk doen toenemen. Het wordt een uitdaging als er meer scenario's worden betrokken en dus meer risico berekeningen nodig zijn in de besluitvorming met betrekking tot de ontwikkeling van de luchthaven en ruimtelijke ordening.

Onderzoekster van de Universiteit Twente ontvangt Nederlandse Prijs voor ICT-Onderzoek ⇒

Informatica-onderzoekster dr. Marieke Huisman ontvangt de Nederlandse Prijs voor ICT-onderzoek 2013. Huisman, verbonden aan het Centre for Telematics and Information Technology (CTIT) van de Universiteit Twente, deed onderzoek naar de betrouwbaarheid en correctheid van parallelle software en ontvangt een geldbedrag van 50.000 euro. Om software sneller te laten draaien, maken de meeste computers en smartphones gebruik van parallelle software. Dit is efficient, maar de verschillende processen kunnen elkaar verstoren, waardoor computers kunnen vastlopen of verkeerde resultaten weergeven. Het onderzoek van Huisman is gericht op logische redeneertechnieken waardoor deze fouten worden verminderd. "Software wordt onder meer gebruikt op belangrijke plekken, bijvoorbeeld in ziekenhuizen, vliegtuigen of in het verkeer. Fouten in deze software kunnen grote gevolgen hebben waardoor het zelfs mensenlevens kan kosten. Mijn onderzoek helpt om deze fouten op te sporen en te verhelpen", aldus Huisman. Het geldbedrag van 50.000 euro is vrij te besteden aan ICT-onderzoek en gaat Huisman gebruiken om het onderzoek uit te breiden naar andere - met name functionele - programmeertalen. De Nederlandse Prijs voor ICT-onderzoek is een unieke prijs voor een wetenschapper die vernieuwend onderzoek verricht of verantwoordelijk is voor een wetenschappelijke doorbraak in de ICT. De prijs is een initiatief van het ICT-onderzoek Platform Nederland (IPN) en de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO) in samenwerking met de Koninklijke Hollandsche Maatschappij der Wetenschappen (KHMW).

Nederlandse internetpioniers krijgen internationale erkenning → Twee Nederlanders, Kees Neggers en Teus Hagen zullen tijdens een internationale ceremonie in Berlijn in augustus worden opgenomen in de zogenaamde Internet Hall of Fame. Beiden speelden een voortrekkersrol in de totstandkoming van het internet in Europa, met een impact ver daarbuiten. Kees Neggers stond aan de basis van een aantal belangrijke internationale organisaties in de internetwereld, waaronder RARE, Internet Society, RIPE NCC, Ebone, CCIRN, de Amsterdam Internet Exchange en GLIF. Neggers vormde samen met Boudewijn Nederkoorn vanaf 1988 de directie van het Nederlandse SURFnet. Onder hun leiding dwong SURFnet wereldwijd erkenning af voor haar internationale voorlopersrol en het onderzoeks- en onderwijsnetwerk groeide in die periode uit tot een van de meest geavanceerde en gerespecteerde ter wereld. Neggers werd een jaar geleden voor zijn verdiensten al onderscheiden als Officier in de Orde van Oranje-Nassau. NLeSC draagt bij tot de ontwikkeling van de werkwijze voor automatische chemische structuur annotatie van massaspectrometrie data → In samenwerking met collega's in Wageningen en Leiden, hebben NLeSC projectleider dr. Lars Ridder (WUR) en eScience engineer Stefan Verhoeven hun ontwikkeling van een systeem om chemische structuur annotatie van massaspectrometrie data te automatiseren gepubliceerd, een cruciale stap in de studie van metabolomics. Dit eMetabolomics project wordt gefinancierd door het Nederland eScience Center en wordt uitgevoerd door de Universiteit van Wageningen en het Nederland eScience Center in samenwerking met het Nederlandse Metabolomics Centre. Het project ontwikkelt op chemo-informatica gebaseerde methodes voor metaboliet identificatie en biochemische netwerk reconstructie in een integratieve metabolomics data-analyse workflow. Trans-Atlantische transmissie van 4K 3D video gedemonstreerd ⇒ Op 25 juni is een speciale demonstratie gegeven voor de deelnemers van de Amerikaanse 'Ignite Application Summit' in Chicago. In de demo werden ultrahoge resolutie video's in 4K 3D gestreamd vanuit het Poznan Supercomputing and Networking Center (PSNC) in Polen naar het Electronic Visualization Laboratory (EVL) aan de Universiteit van Illinois in Chicago (UIC). De Global Lambda Integrated Facility (GLIF), een wereldwijde virtuele collaboratie van netwerkproviders voor onderwijs en onderzoek en het America Connects to Europe (ACE) project, maakten netwerkcapaciteit beschikbaar voor deze lange afstand videostreaming-demonstratie over zo'n 10.000 km. Netherlight, een initiatief van SURFnet, was het knooppunt in Amsterdam voor de connectiviteit tussen Polen en de Verenigde Staten. Studie van Neuroscience Campus Amsterdam onthult nieuwe genetische associaties met opleidingsniveau → Een wereldwijd consortium van medische onderzoekers en sociale wetenschappers heeft ontdekt dat kleine verschillen tussen genetische sequenties van een persoon worden geassocieerd met opleidingsniveau. De studie werd uitgevoerd door het Social Science Genetic Association Consortium, geleid door dr. Philipp Koellinger aan de Erasmus Universiteit Rotterdam. Een groot deel van de genetische analyses werden uitgevoerd door de Nederlandse Genetische Cluster Computer, die deel uitmaakt van het LISA cluster op SURFsara. Prof. Danielle Posthuma van de Vrije Universiteit Amsterdam en Erasmus MC, die de leiding over de Genetische Cluster Computer heeft en meewerkte aan het onderzoek, licht toe: "Deze studie was uitzonderlijk qua steekproefgrootte en bevatte genetische informatie van meer dan 125.000 mensen. Opleidingsniveau is - net als veel andere menselijke trekken - een zogenaamde complexe eigenschap, die wordt beinvloed door honderden genetische en omgevingsinvloeden, elk met een klein effect. We hebben enorm veel steekproefmateriaal nodig om deze kleine effecten te _______________________________________________ gridforum-bestuur mailing list gridforum-bestuur@nikhef.nl https://mailman.nikhef.nl/mailman/listinfo/gridforum-bestuur